২০১৬ খ্রিষ্টাব্দে প্রথম চক্রে শিক্ষক নিয়োগের পর ম্যানেজিং কমিটি বা গভর্নিং বডি না থাকা প্রতিষ্ঠানের শিক্ষকদের নিয়োগপত্র জারি করা নিয়ে জটিলতা সৃষ্টি হয়েছিল। এ জটিলতা নিরসনে সে বছরের ২০ নভেম্বর এ নির্দেশনা জারি করেছিলো এনটিআরসিএ।

এতে বলা হয়েছিল, ‘যেসব বেসরকারি শিক্ষা প্রতিষ্ঠানে ম্যানেজিং কমিটি বা গভর্নিং বডি নেই এবং প্রতিষ্ঠান থেকে নিয়োগপত্র জারি করার ক্ষেত্রে জটিলতা সৃষ্টি হচ্ছে, সেসব শিক্ষা প্রতিষ্ঠানের জটিলতা নিরসনের লক্ষ্যে শিক্ষা প্রতিষ্ঠানের প্রধান এনটিআরসিএর সুপারিশকৃত শিক্ষকদের যোগদানের সুবিধার্থে নিয়োগপত্র জারি করবেন। তবে, সংশ্লিষ্ট প্রতিষ্ঠানের ম্যানেজিং কমিটি/গভর্নিং বডি গঠনের পর উক্ত শিক্ষকদের নিয়োগপত্র ভূতাপেক্ষ অনুমোদন গ্রহণ করতে হবে।

নির্দেশনায় আরও বলা হয়েছিল, যেসব বেসরকারি শিক্ষা প্রতিষ্ঠানে কমিটি নেই, সেসব শিক্ষা প্রতিষ্ঠানে দ্রুত কমিটি গঠনের প্রয়োজনীয় ব্যবস্থা গ্রহণ করতে হবে।

একই নির্দেশনায় সরকারিকরণের প্রক্রিয়াধীন যেসব কলেজে এনটিআরসিএর মাধ্যমে শিক্ষকদের সুপারিশ করা হয়েছে তাদের জাতীয়করণের জন্য পরিদর্শন প্রতিবেদনে তাদের অন্তর্ভুক্ত করার নির্দেশনা দেয়া হয়েছিল।